Le C3MAG résulte de la fusion du Service Interrégional de Microscopie des Antilles et de la Guyane (SIMAG) créé en 1992 sous l’impulsion des Dr Liliane FRENKIEL et Marcel MOUEZA enseignant chercheurs en Biologie Marine et du Centre Commun de Caractérisation des Matériaux (C3M) créé en 1998 sous l’impulsion du Prof. Jean-Louis MANSOT enseignant chercheur en Physique de la Matière Condensée.
Le C3MAG a été agréé par le Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche comme Programme Pluri Formation (PPF) dès sa création en 2002. Il est devenu en 2010 une Structure Fédérative Ministère (FED).
Le C3MAG met à disposition de l’ensemble des équipes de recherche de l’Université des Antilles et des organismes de recherche présents dans les régions Guadeloupe Martinique et Guyane des moyens de caractérisation indispensables aux développements de leurs thématiques de recherche.
Le C3MAG est aussi ouvert aux utilisateurs de la zone Caraïbe Amérique et organise, pour leur permettre un accès optimal aux équipements, des « écoles d’été Caribéennes » dont les thématiques sont centrées sur les techniques dont le C3MAG est expert. Enfin, le C3MAG met ses équipements et ses compétences à la disposition des industriels des trois régions sous forme d’expertises, d’analyses de matériaux ou de contrats de recherche - développement. Afin de satisfaire les demandes des différentes équipes, le C3MAG a acquis au cours des cinq dernières années quelques équipements mis lourds remarquables : deux microscopes électroniques, un microscope Raman confocal multi sources, un microscope confocal.
Un microscope électronique à balayage environnemental équipé d'un détecteur de rayons X permettant non seulement la caractérisation conventionnel d'échantillons métalliques ou minéraux mais aussi l'étude de matériaux hydratés (micro-organismes, tissus biologiques...) sans préparation spécifique.
Un microscope électronique en transmission 200kV à canon à émission de champ équipé d'un détecteur de rayons X et d'un filtre en énergie permettant la caractérisation ultra-structurale de matériaux.
Au delà de ses missions de service le C3MAG développe des travaux de recherche en microscopie électronique et en spectrométrie Raman qui font l’objet de publications et de conférences internationales il conçoit, construit et développe des instruments scientifiques (tribomètres, nanomanipulateurs, capteurs…) dont certain font l’objet de brevets.